自然保護區以保護包含某個(gè)核心對象的陸地及水體為主要任務(wù)，所以，自然保護區應該保護的是有代表性的生態(tài)系統、珍稀瀕危動(dòng)物的天然集中分布區、水源涵養區、珍貴地質(zhì)建造、地質(zhì)剖面和化石產(chǎn)地等。一個(gè)國家的自然保護區體系，一般要求保護類(lèi)型比較齊全、布局比較合理，這樣生態(tài)效益和社會(huì )效益才比較明顯。

　　一個(gè)管理和建設得較好的自然保護區體系，常常也是能夠直接產(chǎn)生持續的經(jīng)濟效益的。國外許多保護區目前已在服務(wù)國家的生物醫學(xué)行業(yè)提供物種源上發(fā)揮了很大的作用，我國這方面的例證也不少。

　　當然，我們應該看到，自然保護區產(chǎn)生經(jīng)濟效益的方法和渠道迥異于通常的資源富集區，自然保護區的建設和管理更著(zhù)重長(cháng)期和宏觀(guān)的效益，對自然保護區的利用和開(kāi)發(fā)，前提是保護，保護區的生態(tài)效益和社會(huì )效益應該被放在首位，眼前的經(jīng)濟效益不能作為保護區建設的工作重點(diǎn)。對這一點(diǎn)，世界發(fā)達國家莫不如是。